Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRCAPQ6ZRS2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SRCAPQ6ZRS2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms