Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNTB1Q13884 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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