Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ECH1Q13011 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ECH1Q13011 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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