Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 YKR078WYKR078W 1758 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 PDR11YIL013C 4236 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SNU114YKL173W 3027 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YCR108CYCR108C 192 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SDC1YDR469W 528 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 ACB1YGR037C 264 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 TWF1YGR080W 999 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YJL147CYJL147C 1149 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 SRP21YKL122C 504 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 PAU23YLR037C 375 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 PDP3YLR455W 915 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YNL150WYNL150W 408 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 ATP3YBR039W 936 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 ALG14YBR070C 714 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 RGL1YPL066W 1440 nt2.41□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YEL043WYEL043W 2871 nt2.4□□□□□ -2.02
RPN5Q12250 YDL163WYDL163W 303 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 VPS74YDR372C 1038 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 ACF4YJR083C 930 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YNR021WYNR021W 1215 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 TRM7YBR061C 933 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 PDR1YGL013C 3207 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 NUP100YKL068W 2880 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 PTP3YER075C 2787 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 SIR3YLR442C 2937 nt2.4□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YGR283CYGR283C 1026 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YHR054CYHR054C 1065 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 ECM9YKR004C 1134 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YMR144WYMR144W 1029 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YMR320WYMR320W 306 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YNL179CYNL179C 438 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YOR055WYOR055W 435 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 KEL2YGR238C 2649 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 VPS16YPL045W 2397 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 VAC8YEL013W 1737 nt2.39□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 PHO2YDL106C 1680 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 PES4YFR023W 1836 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 ECM25YJL201W 1800 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YNL034WYNL034W 1839 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 snR5snR5 204 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 snR70snR70 164 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 MST27YGL051W 705 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 RCN1YKL159C 636 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YOR050CYOR050C 348 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 GIS1YDR096W 2685 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 CBF2YGR140W 2871 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 ESL2YKR096W 3588 nt2.38□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 ECM5YMR176W 4236 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 SAK1YER129W 3429 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 IRC2YDR112W 309 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 TAP42YMR028W 1101 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 IGO1YNL157W 507 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YOL029CYOL029C 606 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YPL034WYPL034W 498 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YCL007CYCL007C 393 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YEF3YLR249W 3135 nt2.37□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YDR537CYDR537C 606 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YGR226CYGR226C 210 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 VPS51YKR020W 495 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YOR364WYOR364W 369 nt2.36□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 APM3YBR288C 1452 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YRB1YDR002W 606 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 TSA2YDR453C 591 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YJL119CYJL119C 324 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 ATP18YML081C-A 180 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 RIO2YNL207W 1278 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 CSM4YPL200W 471 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 TAZ1YPR140W 1146 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 GAL80YML051W 1308 nt2.35□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 NEW1YPL226W 3591 nt2.34□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YJL070CYJL070C 2667 nt2.34□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 YDL009CYDL009C 324 nt2.34□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 snR9snR9 187 nt2.34□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 GPI8YDR331W 1236 nt2.34□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 PET191YJR034W 327 nt2.34□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 HHT2YNL031C 411 nt2.34□□□□□ -2.03
RPN5Q12250 SSE1YPL106C 2082 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 MRP10YDL045W-A 288 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 YFH1YDL120W 525 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 TIM9YEL020W-A 264 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 TMA20YER007C-A 546 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 SNO3YFL060C 669 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 YGL042CYGL042C 306 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 MRM2YGL136C 963 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 PRP21YJL203W 843 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 HRI1YLR301W 735 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 SNO2YNL334C 669 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 RPL25YOL127W 429 nt2.33□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 REF2YDR195W 1602 nt2.32□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 DNA2YHR164C 4569 nt2.32□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.32□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 RPL29YFR032C-A 180 nt2.32□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 AIM19YIL087C 474 nt2.32□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 EMC6YLL014W 327 nt2.32□□□□□ -2.04
RPN5Q12250 PAU8YAL068C 363 nt2.32□□□□□ -2.04
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