Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BNC1Q01954 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BNC1Q01954 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms