Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PRCDQ00LT1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRCDQ00LT1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms