Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP8P40818 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP8P40818 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP8P40818 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP8P40818 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP8P40818 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP8P40818 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms