Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HLA-DMAP28067 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HLA-DMAP28067 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms