Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX1P22670 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX1P22670 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX1P22670 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX1P22670 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX1P22670 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX1P22670 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX1P22670 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX1P22670 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms