Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF1P21675 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF1P21675 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1P21675 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1P21675 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF1P21675 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF1P21675 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF1P21675 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms