Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD53P19397 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD53P19397 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD53P19397 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CD53P19397 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD53P19397 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD53P19397 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CD53P19397 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CD53P19397 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CD53P19397 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CD53P19397 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CD53P19397 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD53P19397 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD53P19397 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD53P19397 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD53P19397 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD53P19397 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD53P19397 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD53P19397 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms