Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IRF1P10914 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IRF1P10914 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IRF1P10914 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IRF1P10914 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
IRF1P10914 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IRF1P10914 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IRF1P10914 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IRF1P10914 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms