Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOC1P02654 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC1P02654 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC1P02654 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC1P02654 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC1P02654 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC1P02654 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC1P02654 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOC1P02654 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOC1P02654 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOC1P02654 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms