Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGR5O75473 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGR5O75473 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LGR5O75473 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGR5O75473 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGR5O75473 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGR5O75473 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGR5O75473 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGR5O75473 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGR5O75473 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGR5O75473 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LGR5O75473 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms