Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF40O75150 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF40O75150 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF40O75150 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF40O75150 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF40O75150 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF40O75150 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF40O75150 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF40O75150 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF40O75150 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF40O75150 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF40O75150 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF40O75150 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF40O75150 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF40O75150 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms