Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IGSF3O75054 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms