Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MCM3APO60318 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCM3APO60318 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms