Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CYTH3O43739 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYTH3O43739 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms