Protein–RNA interactions for Protein: O43174

CYP26A1, Cytochrome P450 26A1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26A1O43174 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CYP26A1O43174 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CYP26A1O43174 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms