Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PIK3C2AO00443 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PIK3C2AO00443 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms