Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVV-1B6SEH8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVV-1B6SEH8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms