Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TTLL13PA6NNM8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms