Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF316A6NFI3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF316A6NFI3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms