Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C5orf51A6NDU8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms