Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM49BA6NDI0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49BA6NDI0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49BA6NDI0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49BA6NDI0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49BA6NDI0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49BA6NDI0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM49BA6NDI0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms