Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DENND3A2RUS2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DENND3A2RUS2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms