Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A0U1RQF3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0U1RQF3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms