Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC4A4Q9Y6R1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms