Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRAPPC8Q9Y2L5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms