Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNND2Q9UQB3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNND2Q9UQB3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms