Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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RRN3Q9NYV6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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RRN3Q9NYV6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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RRN3Q9NYV6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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RRN3Q9NYV6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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RRN3Q9NYV6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RRN3Q9NYV6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RRN3Q9NYV6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RRN3Q9NYV6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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