Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CWC25Q9NXE8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CWC25Q9NXE8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms