Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CIPCQ9C0C6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIPCQ9C0C6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms