Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSB4

ATG101, Autophagy-related protein 101, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101Q9BSB4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATG101Q9BSB4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATG101Q9BSB4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms