Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF559Q9BR84 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms