Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLF1Q9BQI6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLF1Q9BQI6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms