Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms