Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PABPC5Q96DU9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms