Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms