Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBASH3BQ8TF42 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBASH3BQ8TF42 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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