Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAXIP1Q6ZW49 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PAXIP1Q6ZW49 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms