Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCN9AQ15858 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCN9AQ15858 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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