Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKIV2LQ15477 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms