Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TUBB3Q13509 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBB3Q13509 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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