Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RIGQ13278 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RIGQ13278 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RIGQ13278 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RIGQ13278 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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