Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 PFY1YOR122C 381 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 TAO3YIL129C 7131 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 MAK5YBR142W 2322 nt3.55□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 VPS3YDR495C 3036 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YER006C-AYER006C-A 318 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YGL015CYGL015C 393 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RPS20YHL015W 366 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 BIG1YHR101C 1008 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 DYN3YMR299C 939 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YDL180WYDL180W 1644 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 SKP2YNL311C 2292 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 VAC14YLR386W 2643 nt3.54□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 SPE1YKL184W 1401 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YDR442WYDR442W 393 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 RTT105YER104W 627 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YLR012CYLR012C 300 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 GIS2YNL255C 462 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YOR053WYOR053W 342 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YOR392WYOR392W 444 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YBR062CYBR062C 543 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 SCY1YGL083W 2415 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.53□□□□□ -1.84
CLF1Q12309 YNL193WYNL193W 1677 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 PEX5YDR244W 1839 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 FRE8YLR047C 2061 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YGR017WYGR017W 894 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 RPS21AYKR057W 264 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YLR269CYLR269C 351 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YBL065WYBL065W 345 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 CDC33YOL139C 642 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 PIS1YPR113W 663 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YPR197CYPR197C 564 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 RPN1YHR027C 2982 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 DAS1YJL149W 1992 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YEL025CYEL025C 3567 nt3.52□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 SSF2YDR312W 1362 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 SSF1YHR066W 1362 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 VAS1YGR094W 3315 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 GCN1YGL195W 8019 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 DRS2YAL026C 4068 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 CHA4YLR098C 1947 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 BMH2YDR099W 822 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 RTT102YGR275W 474 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 DLS1YJL065C 504 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 PKR1YMR123W 369 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 MNT3YIL014W 1893 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 STT4YLR305C 5703 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 MIT1YEL007W 2001 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 VTC4YJL012C 2166 nt3.51□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YDL009CYDL009C 324 nt3.5□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 USE1YGL098W 738 nt3.5□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.5□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YML099W-AYML099W-A 330 nt3.5□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YOR199WYOR199W 330 nt3.5□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 MUB1YMR100W 1863 nt3.5□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 RIM13YMR154C 2184 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 HAA1YPR008W 2085 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 RPB9YGL070C 369 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 MBB1YJL199C 327 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 HIT1YJR055W 495 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 UNG1YML021C 1080 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 SSN8YNL025C 972 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 RRM3YHR031C 2172 nt3.49□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 RGC1YPR115W 3252 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 BI4Q0120 1917 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 JIP5YPR169W 1479 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 CDC55YGL190C 1581 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 GPI19YDR437W 423 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YGR053CYGR053C 852 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 PDR17YNL264C 1053 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YPL225WYPL225W 441 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 KAR9YPL269W 1935 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YDR061WYDR061W 1620 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YSP2YDR326C 4317 nt3.48□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 SPP382YLR424W 2127 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 MAL33YBR297W 1407 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 CCT7YJL111W 1653 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 RPL30YGL030W 318 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YGL042CYGL042C 306 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 DFG10YIL049W 762 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 PEP8YJL053W 1140 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YAL037WYAL037W 804 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 COX8YLR395C 237 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 NOP15YNL110C 663 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YOL134CYOL134C 390 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 NTC20YBR188C 423 nt3.47□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 CIN8YEL061C 3003 nt3.46□□□□□ -1.85
CLF1Q12309 YKL222CYKL222C 2118 nt3.46□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 BNI4YNL233W 2679 nt3.46□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 RPS1AYLR441C 768 nt3.46□□□□□ -1.86
CLF1Q12309 YSY6YBR162W-A 198 nt3.46□□□□□ -1.86
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