Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 RTS3YGR161C 792 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 DYN3YMR299C 939 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YOR392WYOR392W 444 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 IRC16YPR038W 360 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 PEX6YNL329C 3093 nt3□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 POL4YCR014C 1749 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 PAM1YDR251W 2493 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 FRE8YLR047C 2061 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 CSR2YPR030W 3366 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 SCY1YGL083W 2415 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 DSF2YBR007C 2211 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 PDC2YDR081C 2778 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 STT4YLR305C 5703 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 RMT2YDR465C 1239 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 RPS20YHL015W 366 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YBR062CYBR062C 543 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YPR197CYPR197C 564 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YDL180WYDL180W 1644 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 SSF1YHR066W 1362 nt2.99□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 TAF2YCR042C 4224 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 HEH2YDR458C 1992 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 GCD6YDR211W 2139 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 PSK1YAL017W 4071 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 KAR9YPL269W 1935 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 ECO1YFR027W 846 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YFR054CYFR054C 579 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 BIG1YHR101C 1008 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YLR269CYLR269C 351 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YOR199WYOR199W 330 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YOR277CYOR277C 309 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 SPE1YKL184W 1401 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 CWH41YGL027C 2502 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 RIM13YMR154C 2184 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 SSF2YDR312W 1362 nt2.98□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 HAA1YPR008W 2085 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YBR259WYBR259W 2067 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 MET5YJR137C 4329 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YGR107WYGR107W 450 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 CWC24YLR323C 780 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 RPL19BYBL027W 570 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 YNL193WYNL193W 1677 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 BI4Q0120 1917 nt2.97□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 MED1YPR070W 1701 nt2.96□□□□□ -1.93
UBX3Q12229 PEX5YDR244W 1839 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 SOK1YDR006C 2706 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 ATP22YDR350C 2055 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 SSE2YBR169C 2082 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YDR193WYDR193W 399 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 GPI19YDR437W 423 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 HIT1YJR055W 495 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 ILV5YLR355C 1188 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 PKR1YMR123W 369 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 CDC33YOL139C 642 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 PIS1YPR113W 663 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YSY6YBR162W-A 198 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 SWD3YBR175W 948 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YCK2YNL154C 1641 nt2.96□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 CDC55YGL190C 1581 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YDL009CYDL009C 324 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 RTT102YGR275W 474 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 LSM8YJR022W 330 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YCL019WYCL019W 5313 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 RGC1YPR115W 3252 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YKL100CYKL100C 1764 nt2.95□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 DRS2YAL026C 4068 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 NOP15YNL110C 663 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 RPL20BYOR312C 519 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 NTC20YBR188C 423 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 GIS4YML006C 2325 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 PCK1YKR097W 1650 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 MUB1YMR100W 1863 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 STE23YLR389C 3084 nt2.94□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 PEP8YJL053W 1140 nt2.93□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YAL037WYAL037W 804 nt2.93□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YKL066WYKL066W 444 nt2.93□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 MRPL38YKL170W 417 nt2.93□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 ARV1YLR242C 966 nt2.93□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 COX8YLR395C 237 nt2.93□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 RPS1AYLR441C 768 nt2.93□□□□□ -1.94
UBX3Q12229 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.4 ms