Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 ROX1YPR065W 1107 nt3.49□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 BFR1YOR198C 1413 nt3.49□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 MAL33YBR297W 1407 nt3.49□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 DAN4YJR151C 3486 nt3.49□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 SDH7YDR511W 402 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 YGR242WYGR242W 309 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 TEN1YLR010C 483 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 TVP18YMR071C 504 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 YNL043CYNL043C 321 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 RRD2YPL152W 1077 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 CHA4YLR098C 1947 nt3.48□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 FUN12YAL035W 3009 nt3.47□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 FRE8YLR047C 2061 nt3.47□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.47□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 YGL042CYGL042C 306 nt3.47□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.47□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 BAR1YIL015W 1764 nt3.47□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 VAS1YGR094W 3315 nt3.47□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 MSR1YHR091C 1932 nt3.46□□□□□ -1.85
SGO1Q08490 YDL152WYDL152W 366 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 NHP2YDL208W 471 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YHL037CYHL037C 402 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YIL054WYIL054W 318 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YOR121CYOR121C 306 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 HOP1YIL072W 1818 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 CHS3YBR023C 3498 nt3.46□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 STP2YHR006W 1626 nt3.45□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 SNT1YCR033W 3681 nt3.45□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 RTT105YER104W 627 nt3.45□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 OTU2YHL013C 924 nt3.45□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 COX23YHR116W 456 nt3.45□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt3.45□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 NSL1YPL233W 651 nt3.45□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 PKH1YDR490C 2301 nt3.45□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 AYT1YLL063C 1425 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 ARG2YJL071W 1725 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 PEX1YKL197C 3132 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 MPS1YDL028C 2295 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 STE14YDR410C 720 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 SMB1YER029C 591 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YPS5YGL259W 498 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 UNG1YML021C 1080 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YPP1YGR198W 2454 nt3.44□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 CIN1YOR349W 3045 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 CEP3YMR168C 1827 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 AIM11YER093C-A 414 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 RPS24BYIL069C 408 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 UBC7YMR022W 498 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 ZEO1YOL109W 342 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YBR137WYBR137W 540 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 SSP1YHR184W 1716 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 OST1YJL002C 1431 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 GCD10YNL062C 1437 nt3.43□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 MSH4YFL003C 2637 nt3.42□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 URA2YJL130C 6645 nt3.42□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YCK2YNL154C 1641 nt3.42□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YDR413CYDR413C 576 nt3.42□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.42□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YPR053CYPR053C 456 nt3.42□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 RED1YLR263W 2484 nt3.42□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 SEA4YBL104C 3117 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 GNT1YOR320C 1476 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 CAF130YGR134W 3369 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 RNH70YGR276C 1662 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 RPS26BYER131W 360 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 SRL3YKR091W 741 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 YNL179CYNL179C 438 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 OST2YOR103C 393 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 snR42snR42 351 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 MUS81YDR386W 1899 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 TOP1YOL006C 2310 nt3.41□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 SRB4YER022W 2064 nt3.4□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 SEC6YIL068C 2418 nt3.4□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 ICR1ICR1 3199 nt3.4□□□□□ -1.86
SGO1Q08490 HMRA2YCR096C 360 nt3.4□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 snR8snR8 190 nt3.4□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 YER097WYER097W 330 nt3.4□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 YGL165CYGL165C 579 nt3.4□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 VOA1YGR106C 798 nt3.4□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 ERP4YOR016C 624 nt3.4□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 URB2YJR041C 3525 nt3.4□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 ATP25YMR098C 1839 nt3.4□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.39□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 ZDS2YML109W 2829 nt3.39□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 HFM1YGL251C 3564 nt3.39□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 HOP2YGL033W 657 nt3.39□□□□□ -1.87
SGO1Q08490 ICY1YMR195W 384 nt3.39□□□□□ -1.87
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