Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB2Q08289 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNB2Q08289 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms