Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YJL206CYJL206C 2277 nt4.79□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 PBS2YJL128C 2007 nt4.79□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 GRS1YBR121C 2004 nt4.79□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 AUA1YFL010W-A 285 nt4.79□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 snR17bsnR17b 332 nt4.79□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 FEX2YPL279C 1128 nt4.79□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 GDB1YPR184W 4611 nt4.79□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 DPB11YJL090C 2295 nt4.79□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 RPS24AYER074W 408 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 RPS27BYHR021C 249 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 RRT15YLR162W-A 189 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 RPS22BYLR367W 393 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 NTC20YBR188C 423 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 YCR023CYCR023C 1836 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 SRP68YPL243W 1800 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 SRS2YJL092W 3525 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 TDA1YMR291W 1761 nt4.78□□□□□ -1.64
BUD20Q08004 ULP1YPL020C 1866 nt4.77□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 IKS1YJL057C 2004 nt4.77□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 PEX8YGR077C 1770 nt4.76□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 NHX1YDR456W 1902 nt4.76□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 SPT10YJL127C 1923 nt4.76□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.76□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 SIN4YNL236W 2925 nt4.76□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 snR46snR46 197 nt4.76□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 VID30YGL227W 2877 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 KAR2YJL034W 2049 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 SSP1YHR184W 1716 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 snR60snR60 104 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 ECT1YGR007W 972 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 LSM1YJL124C 519 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 PCC1YKR095W-A 267 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YBL028CYBL028C 321 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 snR52snR52 92 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 AIM9YER080W 1884 nt4.75□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 MIP6YHR015W 1980 nt4.74□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 GAC1YOR178C 2382 nt4.74□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.74□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YBR259WYBR259W 2067 nt4.74□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 TPS3YMR261C 3165 nt4.73□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 MET12YPL023C 1974 nt4.73□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 PRP42YDR235W 1635 nt4.73□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 MIM2YLR099W-A 264 nt4.73□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 MRPL33YMR286W 261 nt4.73□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YMR321CYMR321C 318 nt4.73□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.73□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.73□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 snR72snR72 98 nt4.72□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YGL217CYGL217C 342 nt4.72□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YJR085CYJR085C 318 nt4.72□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt4.72□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 FLC1YPL221W 2382 nt4.72□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 SYF1YDR416W 2580 nt4.72□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 TRM2YKR056W 1920 nt4.72□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 ALG8YOR067C 1734 nt4.72□□□□□ -1.65
BUD20Q08004 CCT7YJL111W 1653 nt4.71□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YNL028WYNL028W 318 nt4.71□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 KRS1YDR037W 1776 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 AXL2YIL140W 2472 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 PIN4YBL051C 2007 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 VPS64YDR200C 1815 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 KRE6YPR159W 2163 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YER091C-AYER091C-A 222 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 MRPL39YML009C 213 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 DAL81YIR023W 2913 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 MES1YGR264C 2256 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 REB1YBR049C 2433 nt4.7□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 EPO1YMR124W 2832 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 PUT2YHR037W 1728 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YHR182WYHR182W 2358 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YMR196WYMR196W 3267 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YHR210CYHR210C 1026 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 ECM15YBL001C 315 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 MGR2YPL098C 342 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YPL182CYPL182C 384 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YPR063CYPR063C 423 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 NRP1YDL167C 2160 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 SSB2YNL209W 1842 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 APC4YDR118W 1959 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 SSH4YKL124W 1740 nt4.69□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 HPA3YEL066W 540 nt4.68□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 TIM13YGR181W 318 nt4.68□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YHL041WYHL041W 450 nt4.68□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 RPL32YBL092W 393 nt4.68□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 STE20YHL007C 2820 nt4.68□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 OAF1YAL051W 3144 nt4.68□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 SWI3YJL176C 2478 nt4.67□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 ECM34YHL043W 513 nt4.67□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt4.67□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 FBP1YLR377C 1047 nt4.67□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 HHT1YBR010W 411 nt4.67□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 NUP116YMR047C 3342 nt4.66□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YDR230WYDR230W 348 nt4.66□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YML037CYML037C 1023 nt4.66□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt4.66□□□□□ -1.66
BUD20Q08004 SFI1YLL003W 2841 nt4.66□□□□□ -1.66
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